تأسست مدارس الفرقان الثانوية عام 1996م ، وعلى مدار السنوات استمرت في التحديث ومواكبة التطور التعليمي في مختلف المجالات والوسائل حتى أصبحت من أكبر المدارس الرائدة في تربية النشئ وتعليم الأجيال .
                    * تشرف على إدارة المدارس لجنة تربوية مؤهلة
                    
                    * إشراف تربوي دائم يقوم به مشرفون مختصون
                    
                    * معلمون ومعلمات بخبرات متميزة
                    
                    * مختبرات حاسوب بأجهزة حديثة موصولة بالشبكة الدولية (الإنترنت) .
                    
                    * مختبرات علمية (فيزياء- كيمياء - أحياء).
                    
                    * مبانٍ حديثة ذات بيئة صفية ملائمة وقاعات واسعة. 
                    
                    * تدفئة مركزية
                    
                    * عرض Data Show
                    
                    * استخدام الألواح الذكية Smart Boards
                    
                    * اعتماد المنهاج المدعم لتعليم الرياضيات والعلوم باللغتين العربية والإنجليزية (Double Language).
                    
                    * مشاغل للتربية المهنية. 
                    
                    * رحلات علمية وترفيهية .
                    
                    * دورات تدريبية للمعلمين والمعلمات.
                    
                    * منهاهج إضافية للثقافة الإسلامية واللغة الإنجليزية والحاسوب.
                    
                    * مستشار للتربية الخاصة
                    
                    * معلمة متخصصة للتقوية في مادتي اللغة العربية والإنجليزية. 
                    
                    * حافلات حديثة ومؤمنة.
                    
                    * ساحات واسعة وملاعب رياضية.
                    
                    *فحوص طبية دورية من قبل أطباء أخصائيين